Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms