Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCAF8Q9UPN6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAF8Q9UPN6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAF8Q9UPN6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAF8Q9UPN6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAF8Q9UPN6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAF8Q9UPN6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAF8Q9UPN6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAF8Q9UPN6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAF8Q9UPN6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAF8Q9UPN6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAF8Q9UPN6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAF8Q9UPN6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms