Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC12A4Q9UP95 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC12A4Q9UP95 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC12A4Q9UP95 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC12A4Q9UP95 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC12A4Q9UP95 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC12A4Q9UP95 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC12A4Q9UP95 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC12A4Q9UP95 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC12A4Q9UP95 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC12A4Q9UP95 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC12A4Q9UP95 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC12A4Q9UP95 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC12A4Q9UP95 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC12A4Q9UP95 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC12A4Q9UP95 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC12A4Q9UP95 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC12A4Q9UP95 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC12A4Q9UP95 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC12A4Q9UP95 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC12A4Q9UP95 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC12A4Q9UP95 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC12A4Q9UP95 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC12A4Q9UP95 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms