Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKX1-2Q9UD57 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX1-2Q9UD57 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX1-2Q9UD57 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX1-2Q9UD57 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX1-2Q9UD57 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX1-2Q9UD57 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX1-2Q9UD57 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX1-2Q9UD57 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX1-2Q9UD57 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX1-2Q9UD57 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX1-2Q9UD57 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX1-2Q9UD57 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX1-2Q9UD57 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX1-2Q9UD57 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX1-2Q9UD57 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX1-2Q9UD57 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX1-2Q9UD57 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX1-2Q9UD57 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX1-2Q9UD57 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX1-2Q9UD57 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX1-2Q9UD57 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX1-2Q9UD57 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX1-2Q9UD57 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX1-2Q9UD57 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NKX1-2Q9UD57 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
NKX1-2Q9UD57 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NKX1-2Q9UD57 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms