Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP35Q9P2H5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
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