Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRHQ9HD43 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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