Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms