Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACCSQ96QU6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACCSQ96QU6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms