Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STAMBPL1Q96FJ0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STAMBPL1Q96FJ0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
STAMBPL1Q96FJ0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STAMBPL1Q96FJ0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
STAMBPL1Q96FJ0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
STAMBPL1Q96FJ0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STAMBPL1Q96FJ0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
STAMBPL1Q96FJ0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STAMBPL1Q96FJ0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
STAMBPL1Q96FJ0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
STAMBPL1Q96FJ0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STAMBPL1Q96FJ0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STAMBPL1Q96FJ0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms