Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms