Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPTQ96BT3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CENPTQ96BT3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPTQ96BT3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPTQ96BT3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPTQ96BT3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPTQ96BT3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPTQ96BT3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms