Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.3■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
HECW1Q76N89 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms