Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMIM5Q71RC9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms