Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRPF40BQ6NWY9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms