Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.915e-6■□□□□ 10.4
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NIPBLQ6KC79 SMCHD1-206ENST00000581631 729 ntTSL 3-0.2□□□□□ -2.445e-6■□□□□ 10.4
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NIPBLQ6KC79 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.271e-13■□□□□ 10.4
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NIPBLQ6KC79 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.426e-7■□□□□ 10.3
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NIPBLQ6KC79 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.666e-7■□□□□ 10.3
NIPBLQ6KC79 CEBPZ-203ENST00000489306 611 ntTSL 2-0.18□□□□□ -2.446e-7■□□□□ 10.3
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NIPBLQ6KC79 GUK1-227ENST00000485083 871 ntTSL 322.28■■□□□ 1.161e-6■□□□□ 10.3
NIPBLQ6KC79 GUK1-235ENST00000493138 694 ntTSL 322.28■■□□□ 1.161e-6■□□□□ 10.3
NIPBLQ6KC79 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.031e-6■□□□□ 10.3
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NIPBLQ6KC79 GUK1-213ENST00000453943 656 ntTSL 1 (best)19.15■□□□□ 0.661e-6■□□□□ 10.3
NIPBLQ6KC79 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.571e-6■□□□□ 10.3
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NIPBLQ6KC79 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.051e-6■□□□□ 10.3
NIPBLQ6KC79 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.021e-6■□□□□ 10.3
NIPBLQ6KC79 GUK1-228ENST00000485168 737 ntTSL 315.03■□□□□ -01e-6■□□□□ 10.3
NIPBLQ6KC79 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.071e-6■□□□□ 10.3
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