Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms