Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM74A1Q5RGS3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms