Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms