Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0Z9

MCMDC2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMDC2Q4G0Z9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCMDC2Q4G0Z9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCMDC2Q4G0Z9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCMDC2Q4G0Z9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCMDC2Q4G0Z9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCMDC2Q4G0Z9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCMDC2Q4G0Z9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCMDC2Q4G0Z9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MCMDC2Q4G0Z9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCMDC2Q4G0Z9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCMDC2Q4G0Z9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCMDC2Q4G0Z9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCMDC2Q4G0Z9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCMDC2Q4G0Z9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCMDC2Q4G0Z9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCMDC2Q4G0Z9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCMDC2Q4G0Z9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms