Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF8Q3BBV2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms