Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFIXQ14938 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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