Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IHHQ14623 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
IHHQ14623 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
IHHQ14623 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
IHHQ14623 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IHHQ14623 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IHHQ14623 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IHHQ14623 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IHHQ14623 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IHHQ14623 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IHHQ14623 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IHHQ14623 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IHHQ14623 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IHHQ14623 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IHHQ14623 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IHHQ14623 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
IHHQ14623 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IHHQ14623 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IHHQ14623 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IHHQ14623 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IHHQ14623 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IHHQ14623 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IHHQ14623 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IHHQ14623 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IHHQ14623 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IHHQ14623 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IHHQ14623 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IHHQ14623 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IHHQ14623 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IHHQ14623 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IHHQ14623 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IHHQ14623 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
IHHQ14623 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IHHQ14623 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IHHQ14623 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IHHQ14623 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IHHQ14623 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IHHQ14623 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IHHQ14623 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IHHQ14623 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IHHQ14623 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IHHQ14623 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IHHQ14623 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IHHQ14623 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IHHQ14623 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IHHQ14623 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IHHQ14623 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IHHQ14623 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IHHQ14623 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IHHQ14623 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IHHQ14623 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IHHQ14623 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IHHQ14623 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IHHQ14623 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IHHQ14623 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IHHQ14623 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IHHQ14623 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IHHQ14623 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IHHQ14623 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IHHQ14623 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IHHQ14623 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IHHQ14623 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IHHQ14623 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IHHQ14623 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IHHQ14623 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IHHQ14623 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IHHQ14623 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IHHQ14623 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IHHQ14623 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms