Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM25Q14258 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM25Q14258 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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