Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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