Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms