Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2IP78347 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms