Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE2HP62256 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2HP62256 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2HP62256 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2HP62256 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2HP62256 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2HP62256 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2HP62256 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2HP62256 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2HP62256 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2HP62256 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2HP62256 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2HP62256 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2HP62256 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2HP62256 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2HP62256 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2HP62256 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2HP62256 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2HP62256 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2HP62256 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2HP62256 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2HP62256 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2HP62256 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2HP62256 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2HP62256 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2HP62256 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2HP62256 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2HP62256 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms