Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
RANGAP1P46060 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms