Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT13P13646 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT13P13646 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT13P13646 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT13P13646 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT13P13646 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT13P13646 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT13P13646 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT13P13646 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT13P13646 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT13P13646 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT13P13646 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT13P13646 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT13P13646 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT13P13646 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT13P13646 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT13P13646 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT13P13646 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT13P13646 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT13P13646 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT13P13646 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT13P13646 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT13P13646 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT13P13646 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT13P13646 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT13P13646 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT13P13646 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT13P13646 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT13P13646 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT13P13646 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT13P13646 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT13P13646 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT13P13646 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT13P13646 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT13P13646 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT13P13646 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT13P13646 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT13P13646 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT13P13646 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT13P13646 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT13P13646 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT13P13646 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT13P13646 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT13P13646 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT13P13646 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT13P13646 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT13P13646 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT13P13646 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT13P13646 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT13P13646 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT13P13646 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT13P13646 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT13P13646 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT13P13646 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT13P13646 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT13P13646 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT13P13646 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT13P13646 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT13P13646 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT13P13646 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT13P13646 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT13P13646 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT13P13646 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT13P13646 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT13P13646 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT13P13646 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT13P13646 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT13P13646 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT13P13646 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT13P13646 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT13P13646 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT13P13646 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT13P13646 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT13P13646 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT13P13646 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT13P13646 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT13P13646 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT13P13646 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT13P13646 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT13P13646 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT13P13646 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT13P13646 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT13P13646 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT13P13646 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT13P13646 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT13P13646 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT13P13646 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT13P13646 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT13P13646 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT13P13646 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT13P13646 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT13P13646 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT13P13646 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT13P13646 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT13P13646 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT13P13646 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT13P13646 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT13P13646 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT13P13646 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRT13P13646 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms