Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms