Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms