Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
B4DEV8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B4DEV8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B4DEV8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
B4DEV8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B4DEV8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B4DEV8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
B4DEV8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B4DEV8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B4DEV8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
B4DEV8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B4DEV8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
B4DEV8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B4DEV8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
B4DEV8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
B4DEV8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B4DEV8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B4DEV8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
B4DEV8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B4DEV8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
B4DEV8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
B4DEV8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
B4DEV8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
B4DEV8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
B4DEV8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
B4DEV8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
B4DEV8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
B4DEV8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
B4DEV8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
B4DEV8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
B4DEV8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
B4DEV8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
B4DEV8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
B4DEV8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
B4DEV8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
B4DEV8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
B4DEV8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
B4DEV8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
B4DEV8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
B4DEV8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
B4DEV8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
B4DEV8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
B4DEV8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
B4DEV8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
B4DEV8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
B4DEV8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
B4DEV8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
B4DEV8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
B4DEV8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
B4DEV8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
B4DEV8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
B4DEV8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
B4DEV8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
B4DEV8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
B4DEV8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
B4DEV8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
B4DEV8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
B4DEV8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
B4DEV8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
B4DEV8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
B4DEV8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
B4DEV8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
B4DEV8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
B4DEV8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
B4DEV8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
B4DEV8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
B4DEV8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
B4DEV8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
B4DEV8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
B4DEV8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
B4DEV8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
B4DEV8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
B4DEV8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
B4DEV8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
B4DEV8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
B4DEV8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
B4DEV8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
B4DEV8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
B4DEV8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
B4DEV8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
B4DEV8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
B4DEV8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
B4DEV8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
B4DEV8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
B4DEV8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
B4DEV8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
B4DEV8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
B4DEV8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
B4DEV8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
B4DEV8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
B4DEV8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
B4DEV8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
B4DEV8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
B4DEV8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
B4DEV8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
B4DEV8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
B4DEV8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
B4DEV8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
B4DEV8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
B4DEV8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms