Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms