Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 C2CD3-201ENST00000313663 6283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 TMPRSS4-219ENST00000616579 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 GTF3C3-201ENST00000263956 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 GRIA2-201ENST00000264426 3445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 RNASEL-201ENST00000367559 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 MRO-211ENST00000610511 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 WDPCP-206ENST00000409562 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 AC092279.2-201ENST00000623742 2189 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 EEF1A1P26-201ENST00000458319 1363 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 DDX24-205ENST00000555054 2769 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 LINC00533-201ENST00000456103 537 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 LINC01608-202ENST00000524283 561 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 AC053481.5-201ENST00000602932 397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 AC133041.1-201ENST00000608389 201 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 TNIK-203ENST00000357327 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 MELK-208ENST00000536987 2125 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 CPM-202ENST00000546373 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 ZNF546-207ENST00000600094 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 AMER1-201ENST00000330258 8443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 MYH11-203ENST00000452625 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 SVIL-203ENST00000375400 6729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 TATDN2P1-201ENST00000443767 2331 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 SCN5A-203ENST00000413689 8504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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PTPRMP28827 TRPS1-201ENST00000220888 5480 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 ZNF566-201ENST00000392170 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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PTPRMP28827 ERMAP-201ENST00000328249 3949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 CD86-201ENST00000264468 2634 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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PTPRMP28827 PARP9-201ENST00000360356 3198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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PTPRMP28827 PPIP5K1-203ENST00000360135 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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PTPRMP28827 ROBO1-204ENST00000467549 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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PTPRMP28827 CHURC1-203ENST00000549115 2629 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 HKR1-223ENST00000591471 3472 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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PTPRMP28827 MORF4L2-208ENST00000441076 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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PTPRMP28827 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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PTPRMP28827 IGLV3-12-201ENST00000390313 356 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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PTPRMP28827 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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PTPRMP28827 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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PTPRMP28827 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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PTPRMP28827 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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PTPRMP28827 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 GJB7-203ENST00000525899 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 TP53BP1-210ENST00000450115 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 CFAP61-205ENST00000377306 2017 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 PTK2B-205ENST00000420218 3941 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 AC127502.2-201ENST00000602663 2351 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 ADAM3A-202ENST00000460383 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 AC108451.1-201ENST00000558208 2520 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 BROX-209ENST00000612948 4028 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 ATMIN-206ENST00000566488 5343 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 GRB10-204ENST00000398812 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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