Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J7

TIMM9, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM9Q9Y5J7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM9Q9Y5J7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TIMM9Q9Y5J7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TIMM9Q9Y5J7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TIMM9Q9Y5J7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TIMM9Q9Y5J7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM9Q9Y5J7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM9Q9Y5J7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM9Q9Y5J7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM9Q9Y5J7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM9Q9Y5J7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM9Q9Y5J7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM9Q9Y5J7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM9Q9Y5J7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM9Q9Y5J7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms