Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID1Q9ULK0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms