Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LRP1BQ9NZR2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms