Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms