Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms