Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMBRA1Q9C0C7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMBRA1Q9C0C7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms