Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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