Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms