Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms