Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6W1

TMCO2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO2Q7Z6W1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMCO2Q7Z6W1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO2Q7Z6W1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO2Q7Z6W1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO2Q7Z6W1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO2Q7Z6W1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO2Q7Z6W1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO2Q7Z6W1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO2Q7Z6W1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO2Q7Z6W1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO2Q7Z6W1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO2Q7Z6W1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO2Q7Z6W1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO2Q7Z6W1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO2Q7Z6W1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO2Q7Z6W1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO2Q7Z6W1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO2Q7Z6W1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO2Q7Z6W1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO2Q7Z6W1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO2Q7Z6W1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO2Q7Z6W1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms