Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms