Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms