Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms