Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms