Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NCOA1Q15788 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
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