Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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